Les séries suivies de * ne sont pas complètes.
62 - Contre-attaque déchaînée
Dépossédé de ses pierres philosophales, le Père des Homonculus à de plus en plus de mal à retenir la Vérité en lui. Il tente de s'échapper afin de retrouver sa puissance, sans savoir qu'il est attendu au tournant par le Fullmetal Alchemist...
63 - De l'autre côté de la Porte
Le Père des Homonculus n'a plus qu'un seul recours : s'emparer du corps de Greed pour regagner de la puissance... Seulement, Lin Yao n'est pas prêt de laisser tomber celui qui l'habite !
64 - Epilogue
La menace Homonculus enfin vaincue, Edward et Alphonse rentrent enfin chez eux avec leurs corps pour vivre en paix et retrouver Winry...
