Les séries suivies de * ne sont pas complètes.
42 - Le début de la contre-attaque
Isolés dans une bâtisse en ruine, Marcoh, Mei et Scar tentent de déchiffrer les documents de recherche sur l'alchimie orientale et font une terrible découverte...
43 - La morsure d'une fourmi
Le groupe mené par Alphonse est arrivé au bidonville des Ishbaliens. Alors qu'il expérimente l'alchimie orientale avec Mei, la chimère Zampano attend l'Homonculus Envy a qui il a dénoncé l'emplacement du Docteur Marcoh...
44 - Plein gaz
Alphonse a retrouvé son père à Lior, au beau milieu de la reconstruction d'une cité en ruines depuis les émeutes qui avaient suivi leur passage. Ce dernier va à présent lui raconter tout ce qu'il sait sur les Homonculus, et leur Père...
45 - Le jour promis
Greed commence à se rappeler de son ancienne existence en tant qu'Homonculus. A cause de cela, il va trouver King Bradley pour exiger des explications...
46 - L'ombre qui approche
Alors que Winry rentre secrètement chez elle à Resembool, elle est surprise de découvrir qu'Edward s'était caché dans sa chambre. De son côté, Alphonse est poursuivi par un Gluttony plus vivant que jamais...
