Les séries suivies de * ne sont pas complètes.
40 - Homonculus
La Générale Armstrong est arrivée à Central City pour rencontrer le Fürhrer. Sur place, elle croise le Flame Alchemist, Roy Mustang, avec qui elle échange quelques mots... Pendant ce temps, le Père des Homonculus se souvient d'un lointain passé, mêlant un jeune Van Hohenheim au royaume de Xerxès...
41 - Abysses
Le groupe du Docteur Marcoh se dirige toujours vers Briggs en passant par les tunnels de la mine. Cependant, à la surface, Kimblee n'est pas dupe et provoque une mise en scène afin de les retrouver...
42 - Le début de la contre-attaque
Isolés dans une bâtisse en ruine, Marcoh, Mei et Scar tentent de déchiffrer les documents de recherche sur l'alchimie orientale et font une terrible découverte...
43 - La morsure d'une fourmi
Le groupe mené par Alphonse est arrivé au bidonville des Ishbaliens. Alors qu'il expérimente l'alchimie orientale avec Mei, la chimère Zampano attend l'Homonculus Envy a qui il a dénoncé l'emplacement du Docteur Marcoh...
44 - Plein gaz
Alphonse a retrouvé son père à Lior, au beau milieu de la reconstruction d'une cité en ruines depuis les émeutes qui avaient suivi leur passage. Ce dernier va à présent lui raconter tout ce qu'il sait sur les Homonculus, et leur Père...
